История учреждения начинается с 1 января 1994 года, когда клуб юных техников «Мы сами», находящийся на балансе подшипникового завода ПЗ-23, был передан Управлению образования и переименован в детский клуб «Лидер».

В 2015 году произошла реорганизация, в результате которой здание на улице Разина, 25 (БОУ ДОД ВО «Областной центр детского (юношеского) научно-технического творчества») передано на баланс МОУ ДОД «Детско-юношеский центр «Лидер».

С января 2016 года юридическое наименование организации – Муниципальное учреждение дополнительного образования «Детско-юношеский центр «Лидер».

В структуру учреждения помимо основного здания, расположенного по адресу: г. Вологда ул. Разина 25, входят структурные подразделения:

• ул. Пугачева д. 57-а, с/п «Водники»
• ул. Пионерская д. 28, с/п «Огонек»-Лоста
• ул. Строителей д. 10, с/п «Прилуки»
• ул. Ярославская д.30, с/п «Бывалово»

В 2015 году произошла реорганизация, в результате которой здание на улице Разина, 25 (БОУ ДОД ВО "Областной центр детского (юношеского) научно-технического творчества») передано на баланс МОУ ДОД «Детско-юношеский центр «Лидер».

С января 2016 года юридическое наименование организации – Муниципальное учреждение дополнительного образования «Детско-юношеский центр «Лидер».

На основании приказа Департамента образования Вологодской области об утверждении пилотных площадок от 16 сентября 2016 года № 2697 учреждение стало региональной пилотной площадкой Департамента образования области по разработке и апробации современных программ технической и естественнонаучной направленности.

В 2017 году МУ ДО ДЮЦ «Лидер» - победитель конкурса лучших практик реализации дополнительных общеобразовательных программ технической и естественнонаучной направленностей муниципальных организаций дополнительного образования Вологодской области; имеет статус муниципального опорного центра технической направленности.

В 2018 году МУ ДО ДЮЦ «Лидер» выиграл федеральный грант на создание Центра цифрового образования детей «IT-Куб», участвуя в конкурсном отборе юридических лиц на предоставление в 2018 году грантов в форме субсидий из федерального бюджета юридическим лицам в целях обеспечения реализации мероприятия «Субсидии на реализацию пилотных проектов по обновлению содержания и технологий дополнительного образования по приоритетным направлениям» приоритетного проекта «Доступное дополнительное образование для детей» направления (подпрограммы) «Развитие дополнительного образования детей и реализация мероприятий молодежной политики» государственной программы Российской Федерации «Развитие образования»). 6 сентября 2018 года состоялось его открытие по адресу: ул. Разина, 25.

В 2019 году МУ ДО ДЮЦ «Лидер» выиграл федеральный грант на создание детского технопарка Кванториум, который был торжественно открыт 26 августа 2019 года при участии заместителя Министра просвещения Российской Федерации Марины Николаевны Раковой и губернатора Вологодской области Олега Александровича Кувшинникова.

С мая 2019 года юридическое наименование организации – Муниципальное автономное учреждение дополнительного образования «Центр творчества» (МАУ ДО «Центр творчества»).